6大研究方向：

（1）河湖健康诊断与生态恢复

针对开放水体尤其是富营养化湖泊和河流，通过理论探索研究、室内外试验和典型小流域应用分析相结合的途径，建立水环境模拟的数学模型，预测水温、营养盐、叶绿素、溶解氧等重要环境要素的时空变化，进行开放水体健康诊断，以及藻类水华预测、预警和控制管理，并注重水环境模型与工程实际应用的结合，提出水污染控制和生态环境的恢复和重建的治理对策，丰富和拓展环境科学与工程的内容；此外，面向我国生态恢复与景观构建领域中重大问题，实现技术创新，获得一批标志性成果，争取在河湖生态系统恢复、立体生态护坡力学机理、生态护坡新技术研究领域获得突破性进展，在立体生态护坡力学机理方面加深理论认识，在生态边坡景观设计及重建方面建立行业技术标准，实现我省边坡工程与生态景观完美结合，为湖北乃至全国的人工边坡加固及生态景观恢复提供技术及人才支撑。

(2)河湖微生物生态与除藻杀藻

在理论方面阐明几个悬而未决的科学问题，如富营养化水体中藻类水华暴发的生物学机理、藻类毒素的发生和归趋规律，蓝藻病毒（噬藻体）的时空分布与遗传多样性以及控制初级生产力水平的程度和对蓝藻水华的影响；微生物溶藻的原理和生物降解藻毒素的机理。在应用方面优选高效溶藻微生物进行配置，对富营养化水体进行联合杀藻试验与应用；利用自主研发的反硝化真菌-细菌联合脱氮技术，结合其它生物技术，清除富营养化水体中的N、P及藻细胞破裂后释放的N、P等元素，从而提高控制富营养化和藻类水华的水平和效率。

(3)藻类生理生态与特种微藻高效养殖技术

阐明非生物因素在微藻生长过程中对其生理方面的影响，并找出最适培养条件下各因素的最佳值。筛选出能够净化水体并且具有高附加值的微藻种类，通过对其生理生化指标的研究，凸显其优势所在，并能够对今后的筛选提供指导依据和参考价值。探讨对不同尺度下高附加值微藻的高密度养殖机制的研究，为优化微藻培养机制提供理论依据。在不同培养规模下通过研究微藻对富营养化水体中氮磷的吸收利用作用，阐明微藻对水体的净化作用和实际净化效率，并通过逐级扩大培养实现微藻在富营养化水体中的大规模高密度培养，做到微藻培养与水体净化同步进行，降低养殖成本，并研究出新的低成本微藻细胞采收技术，提高收集效率减少损失，实现资源最优化、成果规模化、各方利益最大化的多赢局面。

(4)水生生物高附加值产物高效分离技术

将酶工程、生物分子修饰及膜分离技术、生物分离技术等新型高效分离手段应用于微藻类、鱼类等水生生物的高附加值产物的开发，全面研发微藻、鱼、虾等水生生物中所含脂肪、蛋白质、、多糖、虾青素及不饱和脂肪酸(EPA、DHA、SDA)等高附加值物质的提取、分离、纯化与功能性产品制作过程，研究得到藻脂肪、藻蛋白、鱼多肽、虾青素与不饱和脂肪酸的分离、提取及纯化系统方法，研究藻类生物柴油的制备工艺，构建水生生物资源综合开发与利用途径。

（5）生态水利学研究方向

（6）海绵城市技术与应用研究方向